Omakotirakentaja joutuu käyttämään monia erilaisia rakennusmateriaaleja. Niiden ympäristövaikutusten vertailu on vaikeaa eikä materiaaleja voi laittaa ehdottomaan paremmuusjärjestykseen.
Apuna vertailussa ovat ympäristömerkit ja ympäristöselosteet. Vertailussa tulee huomioida valmistuksen ja käytön aikaiset ympäristö- ja terveysvaikutukset. Näitä ovat esimerkiksi raaka-aineen saatavuus ja uusiutuvuus, valmistuksen energiankulutus, päästöt ja materiaalin kierrätettävyys.
Kivi on rakennusmateriaalina kestävä ja monipuolinen. Se on palamaton, eristää hyvin ääntä ja varastoi lämpöä. Puhdasta betoni- ja tiilijätettä kierrätetään maanrakennusaineeksi. Kivirakentamisen haittoja ovat suuri energiankulutus, mineraalien hankinnasta aiheutuvat maisemavauriot sekä raskaat kuljetukset.
Lasin valmistusmateriaalit eli kvartsihiekka, sooda, kalkki ja dolomiitti ovat melko runsaina esiintyviä raaka-aineita. Lasin tuotannossa vapautuu rikkidioksidia, typpioksideja ja pölyä. Lasivillaeriste valmistetaan keräyslasista. Suurten ikkunapintojen haittana on energiahukka. Toisaalta ikkunat vähentävät keinovalon tarvetta.
Metallit ovat kestäviä ja pitkäikäisiä materiaaleja, mutta niiden valmistus kuluttaa paljon energiaa, saastuttaa ympäristöä ja aiheuttaa maisemavaurioita. Alumiinin valmistus kuluttaa erityisen paljon energiaa. Metallit ovat uusiutumattomia luonnonvaroja ja niiden varannot ovat rajallisia. Metallituotteet ovat hyvin kierrätettävissä.
Muovituotteiden raaka-aine on uusiutumaton maaöljy. Muovin jalostuksessa käytetään ympäristölle haitallisia kemikaaleja. Rakennusmuovien etuna on keveys. Muovi voi korvata uusiutumattomasta metallista valmistettuja putkia ja osia. Ympäristön kannalta ongelmallisia ovat mm. PVC-muovit, bromatut palonestoaineet ja muovien pehmittimet, kuten ftalaatit. Kierrätystä haittaa muovilaatujen lukuisuus.
Perinteiset rakennusaineet ovat yleensä uusiutuvia ja läheltä saatavissa. Niiden valmistus ei saastuta ja ne ovat käytössä turvallisia. Rakennus- ja purkujätteet voidaan käsitellä paikallisesti ja monet purkumateriaaleista voidaan kierrättää uudelleen rakennusaineiksi. Myös korjaaminen on helppoa, mikä lisää rakenteiden pitkäikäisyyttä.
Puu on uusiutuva luonnonvara, sen valmistus ja työstö kuluttavat vähän energiaa ja kierrättäminen on helppoa. Raaka-aine saadaan usein läheltä. Puurakenteet ovat sisäilman kannalta turvallisia ja myös helposti korjattavissa ja muunneltavissa. Puun käytön haittapuolena on sen alttius kosteudelle, homeelle ja auringonvalolle.