Luonnonmukaiset lannoitteet korvaavat öljypohjaiset typpilannoitteet ja muut väkilannoitteet.
Kompostointiin perustuvat luonnonlannoitteet ovat hidasliukoisia, eli niistä ravinteet imeytyvät maahan hitaammin ja täydellisemmin kuin nopealiukoisista väkilannoitteista. Tällöin vähennetään myös ravinteiden huuhtoutumista vesistöön. Luonnonmukaisessa viljelyssä hyväksytään mm. seuraavia luonnosta saatavia lannoitteita:
Luonnonlannoitteen hajua voi vähentää peittämällä lannoite mullalla. Se auttaa myös lannoitteen imeytymistä maaperään.